条带弱、背景高、结果飘......做磷酸化蛋白Western Blot(WB)的痛谁懂!!!磷酸化蛋白WB之所以成为实验室“噩梦”,本质是低丰度+高动态+易降解等原因,任何一步操作的偏差都会导致信号丢失或非特异性信号放大。今天Dr. Connie会对磷酸化蛋白WB实验的痛点进行分析,并分享磷酸化蛋白WB实验改善建议。
磷酸化蛋白WB痛点及解决方案
样本制备
1、 占比小:磷酸化蛋白通常仅占总蛋白总量的1%-10%,需检测的信号接近WB检测下限。
2、 动态范围窄:激酶/磷酸酶活性变化导致磷酸化水平在几分钟内波动(如EGF刺激后EGFR磷酸化5分钟达到峰值,30分钟降至基线),易错过真实信号。
3、 磷酸酶持续作用:细胞裂解后会释放大量内源性蛋白磷酸酶,短时间内可催化磷酸化蛋白的去磷酸化,导致磷酸化水平衰减。
4、 温度敏感:室温下磷酸化蛋白半衰期仅数分钟(如MAPK磷酸化在25℃下10分钟降解90%)。
综上所述,磷酸化蛋白WB成功的关键首先在于蛋白样品的质量!所以部分磷酸化蛋白WB实验失败,可能是因为样品制备出了问题,因此该环节尤其重要!
因此,蛋白提取过程中全程冰浴,保证低温操作;蛋白裂解液按比例加入磷酸酶抑制剂及蛋白酶抑制剂,防止蛋白降解或去磷酸化;为保证磷酸化活性,尽量使用新鲜蛋白样本,液氮速冻,-80℃分装保存,避免反复冻融;电泳时保证足够的蛋白上样量。
抗体选择
1、 查阅高分或相关文献,确定目的蛋白磷酸化位点,选用已验证过的磷酸化抗体,使用高效的磷酸化抗体,能提高信号灵敏度(不同批次抗体可能灵敏度差异大,建议同一类型实验使用同一批次抗体)。
2、 总蛋白表达量可作为另一种形式的内参蛋白,可区分磷酸化蛋白表达量是和总蛋白表达量动态一致,还是未改变总蛋白表达量,只是磷酸化水平有变。因此除了设置常用的GAPDH/β-actin内参蛋白外,建议同步检测总蛋白表达量(例如你要检测Akt磷酸化水平,也要同步检测Akt蛋白表达水平,只有磷酸化蛋白/总蛋白的比值变化,才能说明磷酸化水平发生相对变化)。
AntibodySystem具有种类齐全的磷酸化抗体产品,产品经多篇文献引用,效果俱佳,如有需求可联系产品专员咨询~
电泳及转膜
1、 根据目的蛋白大小选择合适胶浓度,电泳全程冰浴,避免温度过高导致磷酸化降解。
2、 磷酸化蛋白WB容易出现非特异性条带,可选用合适的蛋白Marker确定目的蛋白大小,避免乌龙结果导致“空欢喜”。
3、 使用新鲜配置的转膜液,可提高转膜效率。
4、 PVDF膜比NC膜更有效的捕捉磷酸化蛋白,更适合磷酸化蛋白的转移。
5、 磷酸化蛋白可能出现转膜效率低等情况,尤其小分子的磷酸化蛋白容易过度转膜,可根据经验适当缩短转膜时间或者降低转膜电压。
封闭及抗体孵育
1、 封闭:封闭液建议使用5% BSA,效果可能优于5%脱脂奶粉(部分同学反映使用脱脂奶粉会导致背景很高,条带弥散等异常情况,可能是由于部分脱脂奶粉中含有磷蛋白——酪蛋白,导致磷酸化蛋白降解引起高背景。也有同学反馈,实验室做磷酸化抗体一直都是用5%脱脂奶粉进行封闭,可根据具体情况进行优化),室温封闭1h即可,封闭时间不宜过长。
2、 抗体孵育:根据抗体厂商说明书中的Protocol对抗体进行稀释,或根据文献中抗体的稀释比例及方法对抗体进行稀释,一抗建议4℃过夜孵育,可让抗体充分结合,以便获取最佳条带,抗体孵育时间及浓度根据实际实验结果进行优化。
磷酸化蛋白WB实验的每个环节都可能影响最终结果,因此要特别注意样品的磷酸化状态,也要根据实际情况不断优化实验条件,确保最终结果的准确性和可重复性!
AntibodySystem可以为客户提供一系列具有高特异性、高灵敏度特点的磷酸化抗体,满足WB、IHC等应用。
部分磷酸化抗体目录:
货号 |
产品名称 |
RGK26901 |
Anti-Pan-pS/pSer/Phosphoserine Antibody (SAA0307) |
RGK60101 |
Anti-Pan-pY/pTyr/Phosphotyrosine Antibody (4G10) |
RHJ88704 |
Anti-Phospho-RIPK3 (pS199) Antibody (SAA0298) |
RMD96501 |
Anti-Phospho-AKT1 (pS473) Antibody (P8.H9) |
RHF62702 |
Anti-Phospho-Histone H3 (pT11) Antibody (N123/19) |
RHJ88701 |
Anti-Phospho-RIP3 (pS227) Antibody (P2.A11) |
RHC82407 |
Anti-Phospho-Tau (pS396/pS404) Antibody (SAA0294) |
RHH20001 |
Anti-Phospho-Smad2 (pT8) Antibody (P4.B9) |