RRID是什么?
RRID全称为Research Resource Identifier,是研究资源的永久且唯一的标识符,用于规范研究资源的引用,促进研究资源的识别和跟踪,提升研究的透明度、可重复性和资源追踪效率。
在科研论文中,研究人员经常使用缩写或未能统一规范地引用研究资源。例如,一篇使用BD CellQuest Pro软件的论文可能会使用“CellQuest”或“CellQuest Pro”或“CellQuest(BD Biosciences)”等名称。RRID为工具提供了一个明确的名称和一个可以与之关联的ID,确保论文中使用的资源没有歧义,提高研究的可重复性。
目前RRID系统涵盖了抗体、细胞系、质粒、模型生物(如转基因小鼠)、软件工具、数据库等关键研究资源。RRID由研究资源提供者或使用者提交、由注册机构分配唯一编号,不可自行编造。
RRID的格式一般由前缀[RRID:]+权威数据源+编号组成,如下图所示:
AB_:抗体注册库(Antibody Registry)
Addgene_:质粒库(Addgene)
MMRRC_:突变小鼠资源库(Mutant Mouse Regional Resource Centers)
CVCL_:细胞系库(Cellosaurus)
SCR_:软件/工具库(SciCrunch Registry)
小分子化合物、蛋白质等其他研究资源不在RRID范围内的,可使用相应的数据库查询或使用标准格式引用,如PubChem SID、UniprotKB ID等。
如何使用RRID?
RRID查询网站为https://scicrunch.org/resources,该网站汇总了每种资源类型最权威的数据源的关键生物试剂和资源的RRID,输入资源名称或目录号即可获取对应RRID及标准引用文本。若查询不到,可能是资源尚未收录,用户可自助注册,审核通过后即可获得正式RRID。
以下是使用示例:
① 网站主页有6个分类,点击相应的分类即可进入查询系统(图1)。
图1.网站首页
② 查询:以AntibodySystem的抗体为例,输入货号PVV13201后点击Search,即可查到该抗体的RRID及标准引用文本(图2)。点击词条即可查看该抗体的详细信息(图3)。此外也可查询某品牌或某靶点的已创建RRID的产品,支持高级检索。
图2.查询示例
图3.抗体的详细信息
③ 创建:若查询不到RRID,可自助注册:点击右上角About-Add a resource或页面下方蓝字提醒(Register an antibody now),根据要求填写相关信息并提交,即可注册(图4),抗体也可以直接登录该网站https://www.antibodyregistry.org/查询或注册(图5)。审核通过后即可获得该资源的RRID及标准引用文本。
图4.自助注册RRID
图5.Antibody Registry 抗体注册